Service Microarray-Analyse

Das Genomics & Transcriptomics Labor des BMFZ führt RNA-Expressionsanalysen im Rahmen von wissenschaftlichen Kooperationen innerhalb des BMFZ bzw. verschiedener Sonderforschungsbereiche (SFB590, SFB612) durch. Dabei kommen sowohl selbst entwickelte als auch kommerzielle Microarray-Plattformen zum Einsatz.

Je nach wissenschaftlicher Fragestellung, Art und Umfang der Analysen sowie den zur Verfügung stehenden finanziellen Mitteln eignen sich die genannten Plattformen unterschiedlich gut. Gerne unterstützen wir Sie bei der Auswahl der geeigneten Plattform sowie bei der Planung der Experimente. Der letztgenannte Punkt ist uns gerade im Hinblick auf eine möglichst effektive Datenauswertung ein besonderes Anliegen.

Datenauswertung

Für alle genannten Plattformen bestehen etablierte Auswertestrategien: Abhängig vom jeweilig verwendeten experimentellen Design kommen verschiedene Software-Pakete zur statistischen Microarray-Datenanalyse zum Einsatz (GeneSpring GX11.5, Partek Genomic Suite, Bioconductor-R-Pakete).